Protein–RNA interactions for Protein: P59780

AP3S2, AP-3 complex subunit sigma-2, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3S2P59780 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AP3S2P59780 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AP3S2P59780 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AP3S2P59780 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AP3S2P59780 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AP3S2P59780 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AP3S2P59780 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AP3S2P59780 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
AP3S2P59780 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AP3S2P59780 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AP3S2P59780 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AP3S2P59780 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AP3S2P59780 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AP3S2P59780 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AP3S2P59780 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AP3S2P59780 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
AP3S2P59780 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC15.06■□□□□ 0
AP3S2P59780 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
AP3S2P59780 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
AP3S2P59780 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
AP3S2P59780 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AP3S2P59780 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC15.06■□□□□ 0
AP3S2P59780 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
AP3S2P59780 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AP3S2P59780 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AP3S2P59780 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AP3S2P59780 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AP3S2P59780 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AP3S2P59780 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
AP3S2P59780 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AP3S2P59780 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AP3S2P59780 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AP3S2P59780 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AP3S2P59780 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AP3S2P59780 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AP3S2P59780 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
AP3S2P59780 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AP3S2P59780 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AP3S2P59780 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AP3S2P59780 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
AP3S2P59780 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AP3S2P59780 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AP3S2P59780 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AP3S2P59780 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AP3S2P59780 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AP3S2P59780 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
AP3S2P59780 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AP3S2P59780 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AP3S2P59780 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AP3S2P59780 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.05■□□□□ -0
AP3S2P59780 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AP3S2P59780 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AP3S2P59780 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
AP3S2P59780 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
AP3S2P59780 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AP3S2P59780 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
AP3S2P59780 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
AP3S2P59780 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
AP3S2P59780 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC15.05■□□□□ -0
AP3S2P59780 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC15.05■□□□□ -0
AP3S2P59780 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AP3S2P59780 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.05■□□□□ -0
AP3S2P59780 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
AP3S2P59780 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC15.05■□□□□ -0
AP3S2P59780 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
AP3S2P59780 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AP3S2P59780 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AP3S2P59780 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
AP3S2P59780 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
AP3S2P59780 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AP3S2P59780 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.05■□□□□ -0
AP3S2P59780 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
AP3S2P59780 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AP3S2P59780 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
AP3S2P59780 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AP3S2P59780 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AP3S2P59780 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AP3S2P59780 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AP3S2P59780 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.05■□□□□ -0
AP3S2P59780 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AP3S2P59780 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
AP3S2P59780 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AP3S2P59780 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AP3S2P59780 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AP3S2P59780 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AP3S2P59780 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AP3S2P59780 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AP3S2P59780 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
AP3S2P59780 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AP3S2P59780 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AP3S2P59780 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AP3S2P59780 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
AP3S2P59780 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AP3S2P59780 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AP3S2P59780 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AP3S2P59780 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
AP3S2P59780 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AP3S2P59780 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
AP3S2P59780 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AP3S2P59780 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms