Protein–RNA interactions for Protein: P56750

CLDN17, Claudin-17, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN17P56750 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms