Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms