Protein–RNA interactions for Protein: P55895

RAG2, V(D)J recombination-activating protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAG2P55895 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAG2P55895 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAG2P55895 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAG2P55895 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAG2P55895 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAG2P55895 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RAG2P55895 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAG2P55895 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RAG2P55895 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RAG2P55895 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RAG2P55895 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RAG2P55895 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RAG2P55895 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RAG2P55895 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
RAG2P55895 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RAG2P55895 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RAG2P55895 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAG2P55895 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAG2P55895 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAG2P55895 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAG2P55895 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAG2P55895 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAG2P55895 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RAG2P55895 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAG2P55895 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAG2P55895 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RAG2P55895 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAG2P55895 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAG2P55895 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAG2P55895 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAG2P55895 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAG2P55895 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAG2P55895 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAG2P55895 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAG2P55895 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RAG2P55895 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAG2P55895 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RAG2P55895 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAG2P55895 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RAG2P55895 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAG2P55895 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAG2P55895 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAG2P55895 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RAG2P55895 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAG2P55895 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAG2P55895 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAG2P55895 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAG2P55895 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAG2P55895 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAG2P55895 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAG2P55895 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAG2P55895 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAG2P55895 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAG2P55895 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAG2P55895 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAG2P55895 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAG2P55895 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAG2P55895 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAG2P55895 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAG2P55895 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAG2P55895 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAG2P55895 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAG2P55895 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAG2P55895 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAG2P55895 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAG2P55895 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAG2P55895 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAG2P55895 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAG2P55895 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAG2P55895 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAG2P55895 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAG2P55895 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAG2P55895 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAG2P55895 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAG2P55895 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAG2P55895 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAG2P55895 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAG2P55895 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RAG2P55895 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RAG2P55895 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAG2P55895 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAG2P55895 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RAG2P55895 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAG2P55895 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RAG2P55895 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RAG2P55895 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAG2P55895 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAG2P55895 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAG2P55895 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RAG2P55895 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAG2P55895 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RAG2P55895 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAG2P55895 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAG2P55895 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAG2P55895 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAG2P55895 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAG2P55895 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAG2P55895 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAG2P55895 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAG2P55895 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms