Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms