Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
GTF2A2P52657 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GTF2A2P52657 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
GTF2A2P52657 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GTF2A2P52657 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GTF2A2P52657 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GTF2A2P52657 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
GTF2A2P52657 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GTF2A2P52657 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GTF2A2P52657 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GTF2A2P52657 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GTF2A2P52657 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GTF2A2P52657 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GTF2A2P52657 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GTF2A2P52657 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GTF2A2P52657 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GTF2A2P52657 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF2A2P52657 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF2A2P52657 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF2A2P52657 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF2A2P52657 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF2A2P52657 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF2A2P52657 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF2A2P52657 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF2A2P52657 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF2A2P52657 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF2A2P52657 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF2A2P52657 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF2A2P52657 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF2A2P52657 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF2A2P52657 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF2A2P52657 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF2A2P52657 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF2A2P52657 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF2A2P52657 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF2A2P52657 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF2A2P52657 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF2A2P52657 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF2A2P52657 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF2A2P52657 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GTF2A2P52657 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GTF2A2P52657 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20■□□□□ 0.79
GTF2A2P52657 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GTF2A2P52657 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GTF2A2P52657 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GTF2A2P52657 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GTF2A2P52657 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GTF2A2P52657 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GTF2A2P52657 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GTF2A2P52657 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GTF2A2P52657 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GTF2A2P52657 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GTF2A2P52657 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
GTF2A2P52657 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC20■□□□□ 0.79
GTF2A2P52657 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GTF2A2P52657 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
GTF2A2P52657 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GTF2A2P52657 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
GTF2A2P52657 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
GTF2A2P52657 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GTF2A2P52657 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
GTF2A2P52657 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GTF2A2P52657 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GTF2A2P52657 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
GTF2A2P52657 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GTF2A2P52657 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GTF2A2P52657 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GTF2A2P52657 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC20■□□□□ 0.79
GTF2A2P52657 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GTF2A2P52657 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GTF2A2P52657 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GTF2A2P52657 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2A2P52657 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2A2P52657 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2A2P52657 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2A2P52657 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2A2P52657 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2A2P52657 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2A2P52657 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2A2P52657 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2A2P52657 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2A2P52657 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2A2P52657 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2A2P52657 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2A2P52657 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2A2P52657 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2A2P52657 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2A2P52657 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2A2P52657 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2A2P52657 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2A2P52657 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2A2P52657 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2A2P52657 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2A2P52657 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2A2P52657 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2A2P52657 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF2A2P52657 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF2A2P52657 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF2A2P52657 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF2A2P52657 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms