Protein–RNA interactions for Protein: P52655

GTF2A1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A1P52655 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2A1P52655 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms