Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DAP3P51398 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DAP3P51398 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DAP3P51398 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DAP3P51398 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DAP3P51398 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DAP3P51398 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DAP3P51398 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DAP3P51398 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DAP3P51398 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DAP3P51398 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DAP3P51398 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DAP3P51398 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DAP3P51398 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DAP3P51398 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DAP3P51398 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DAP3P51398 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DAP3P51398 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DAP3P51398 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DAP3P51398 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DAP3P51398 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
DAP3P51398 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DAP3P51398 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DAP3P51398 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DAP3P51398 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DAP3P51398 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DAP3P51398 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DAP3P51398 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
DAP3P51398 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DAP3P51398 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DAP3P51398 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DAP3P51398 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DAP3P51398 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DAP3P51398 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DAP3P51398 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DAP3P51398 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DAP3P51398 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DAP3P51398 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DAP3P51398 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DAP3P51398 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
DAP3P51398 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DAP3P51398 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DAP3P51398 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DAP3P51398 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DAP3P51398 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DAP3P51398 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DAP3P51398 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DAP3P51398 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DAP3P51398 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DAP3P51398 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DAP3P51398 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DAP3P51398 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DAP3P51398 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DAP3P51398 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DAP3P51398 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DAP3P51398 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DAP3P51398 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DAP3P51398 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DAP3P51398 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DAP3P51398 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DAP3P51398 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DAP3P51398 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DAP3P51398 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DAP3P51398 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DAP3P51398 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DAP3P51398 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DAP3P51398 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DAP3P51398 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DAP3P51398 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DAP3P51398 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DAP3P51398 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DAP3P51398 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DAP3P51398 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DAP3P51398 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DAP3P51398 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DAP3P51398 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DAP3P51398 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DAP3P51398 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DAP3P51398 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DAP3P51398 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DAP3P51398 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DAP3P51398 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DAP3P51398 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DAP3P51398 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DAP3P51398 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DAP3P51398 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DAP3P51398 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DAP3P51398 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DAP3P51398 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DAP3P51398 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
DAP3P51398 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DAP3P51398 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DAP3P51398 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DAP3P51398 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DAP3P51398 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DAP3P51398 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DAP3P51398 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DAP3P51398 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DAP3P51398 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DAP3P51398 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms