Protein–RNA interactions for Protein: P49458

SRP9, Signal recognition particle 9 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP9P49458 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRP9P49458 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRP9P49458 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRP9P49458 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRP9P49458 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRP9P49458 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRP9P49458 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRP9P49458 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRP9P49458 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRP9P49458 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRP9P49458 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRP9P49458 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRP9P49458 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRP9P49458 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRP9P49458 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRP9P49458 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRP9P49458 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRP9P49458 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRP9P49458 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRP9P49458 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRP9P49458 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRP9P49458 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRP9P49458 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRP9P49458 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRP9P49458 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRP9P49458 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRP9P49458 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRP9P49458 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRP9P49458 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRP9P49458 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRP9P49458 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRP9P49458 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRP9P49458 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SRP9P49458 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRP9P49458 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRP9P49458 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRP9P49458 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRP9P49458 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRP9P49458 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRP9P49458 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRP9P49458 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRP9P49458 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRP9P49458 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRP9P49458 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRP9P49458 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRP9P49458 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRP9P49458 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRP9P49458 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRP9P49458 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRP9P49458 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRP9P49458 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRP9P49458 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SRP9P49458 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRP9P49458 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRP9P49458 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRP9P49458 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRP9P49458 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRP9P49458 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRP9P49458 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRP9P49458 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRP9P49458 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRP9P49458 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRP9P49458 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRP9P49458 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRP9P49458 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRP9P49458 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SRP9P49458 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRP9P49458 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRP9P49458 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRP9P49458 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SRP9P49458 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRP9P49458 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SRP9P49458 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRP9P49458 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRP9P49458 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRP9P49458 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRP9P49458 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRP9P49458 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRP9P49458 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRP9P49458 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SRP9P49458 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SRP9P49458 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRP9P49458 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRP9P49458 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRP9P49458 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRP9P49458 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRP9P49458 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRP9P49458 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRP9P49458 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRP9P49458 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRP9P49458 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRP9P49458 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRP9P49458 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRP9P49458 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRP9P49458 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRP9P49458 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRP9P49458 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRP9P49458 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRP9P49458 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRP9P49458 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms