Protein–RNA interactions for Protein: P49279

SLC11A1, Natural resistance-associated macrophage protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC11A1P49279 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC11A1P49279 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC11A1P49279 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC11A1P49279 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC11A1P49279 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC11A1P49279 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC11A1P49279 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC11A1P49279 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC11A1P49279 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC11A1P49279 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC11A1P49279 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC11A1P49279 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC11A1P49279 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC11A1P49279 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC11A1P49279 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC11A1P49279 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC11A1P49279 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC11A1P49279 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC11A1P49279 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC11A1P49279 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC11A1P49279 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC11A1P49279 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC11A1P49279 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC11A1P49279 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC11A1P49279 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC11A1P49279 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC11A1P49279 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC11A1P49279 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC11A1P49279 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC11A1P49279 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC11A1P49279 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC11A1P49279 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC11A1P49279 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC11A1P49279 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC11A1P49279 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC11A1P49279 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC11A1P49279 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC11A1P49279 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC11A1P49279 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC11A1P49279 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC11A1P49279 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC11A1P49279 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC11A1P49279 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC11A1P49279 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC11A1P49279 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC11A1P49279 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC11A1P49279 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC11A1P49279 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC11A1P49279 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC11A1P49279 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC11A1P49279 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC11A1P49279 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC11A1P49279 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC11A1P49279 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC11A1P49279 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC11A1P49279 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC11A1P49279 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC11A1P49279 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC11A1P49279 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC11A1P49279 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC11A1P49279 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC11A1P49279 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC11A1P49279 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC11A1P49279 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC11A1P49279 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC11A1P49279 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC11A1P49279 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC11A1P49279 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC11A1P49279 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC11A1P49279 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC11A1P49279 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC11A1P49279 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC11A1P49279 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC11A1P49279 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC11A1P49279 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC11A1P49279 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC11A1P49279 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC11A1P49279 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC11A1P49279 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC11A1P49279 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC11A1P49279 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC11A1P49279 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC11A1P49279 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC11A1P49279 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC11A1P49279 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC11A1P49279 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC11A1P49279 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC11A1P49279 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC11A1P49279 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC11A1P49279 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC11A1P49279 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC11A1P49279 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC11A1P49279 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC11A1P49279 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC11A1P49279 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC11A1P49279 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC11A1P49279 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC11A1P49279 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC11A1P49279 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC11A1P49279 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms