Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NESP48681 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
NESP48681 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NESP48681 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NESP48681 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NESP48681 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NESP48681 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NESP48681 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NESP48681 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NESP48681 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NESP48681 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NESP48681 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NESP48681 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NESP48681 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NESP48681 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NESP48681 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
NESP48681 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NESP48681 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NESP48681 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NESP48681 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NESP48681 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NESP48681 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NESP48681 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NESP48681 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NESP48681 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NESP48681 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NESP48681 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NESP48681 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NESP48681 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NESP48681 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NESP48681 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NESP48681 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NESP48681 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NESP48681 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NESP48681 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NESP48681 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NESP48681 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NESP48681 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NESP48681 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NESP48681 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NESP48681 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NESP48681 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NESP48681 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
NESP48681 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NESP48681 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NESP48681 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NESP48681 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
NESP48681 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NESP48681 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NESP48681 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NESP48681 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NESP48681 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NESP48681 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NESP48681 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NESP48681 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NESP48681 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NESP48681 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NESP48681 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NESP48681 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NESP48681 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NESP48681 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NESP48681 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NESP48681 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
NESP48681 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
NESP48681 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
NESP48681 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.35
NESP48681 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
NESP48681 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
NESP48681 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
NESP48681 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
NESP48681 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
NESP48681 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.34
NESP48681 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
NESP48681 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
NESP48681 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
NESP48681 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.34
NESP48681 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC29.7■■■□□ 2.34
NESP48681 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
NESP48681 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.34
NESP48681 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
NESP48681 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
NESP48681 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
NESP48681 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NESP48681 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
NESP48681 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
NESP48681 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
NESP48681 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
NESP48681 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
NESP48681 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC29.69■■■□□ 2.34
NESP48681 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
NESP48681 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
NESP48681 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
NESP48681 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
NESP48681 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
NESP48681 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
NESP48681 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
NESP48681 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NESP48681 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NESP48681 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
NESP48681 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms