Protein–RNA interactions for Protein: P48380

RFX3, Transcription factor RFX3, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX3P48380 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFX3P48380 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFX3P48380 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFX3P48380 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFX3P48380 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFX3P48380 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFX3P48380 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFX3P48380 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFX3P48380 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFX3P48380 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RFX3P48380 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFX3P48380 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFX3P48380 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFX3P48380 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFX3P48380 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFX3P48380 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFX3P48380 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFX3P48380 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFX3P48380 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFX3P48380 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFX3P48380 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFX3P48380 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFX3P48380 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFX3P48380 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFX3P48380 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFX3P48380 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFX3P48380 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFX3P48380 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFX3P48380 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFX3P48380 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RFX3P48380 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFX3P48380 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFX3P48380 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFX3P48380 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFX3P48380 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFX3P48380 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFX3P48380 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFX3P48380 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFX3P48380 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFX3P48380 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFX3P48380 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFX3P48380 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFX3P48380 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFX3P48380 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFX3P48380 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RFX3P48380 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFX3P48380 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFX3P48380 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFX3P48380 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFX3P48380 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFX3P48380 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFX3P48380 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFX3P48380 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFX3P48380 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RFX3P48380 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFX3P48380 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFX3P48380 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFX3P48380 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFX3P48380 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFX3P48380 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFX3P48380 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFX3P48380 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFX3P48380 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFX3P48380 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFX3P48380 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFX3P48380 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFX3P48380 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFX3P48380 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFX3P48380 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFX3P48380 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFX3P48380 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFX3P48380 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFX3P48380 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFX3P48380 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFX3P48380 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFX3P48380 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFX3P48380 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFX3P48380 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFX3P48380 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFX3P48380 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFX3P48380 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFX3P48380 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFX3P48380 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFX3P48380 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFX3P48380 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFX3P48380 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFX3P48380 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFX3P48380 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFX3P48380 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFX3P48380 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RFX3P48380 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFX3P48380 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RFX3P48380 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFX3P48380 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFX3P48380 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFX3P48380 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFX3P48380 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFX3P48380 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFX3P48380 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFX3P48380 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms