Protein–RNA interactions for Protein: P46094

XCR1, Chemokine XC receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCR1P46094 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
XCR1P46094 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
XCR1P46094 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
XCR1P46094 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
XCR1P46094 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
XCR1P46094 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
XCR1P46094 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
XCR1P46094 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
XCR1P46094 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
XCR1P46094 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
XCR1P46094 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
XCR1P46094 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
XCR1P46094 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
XCR1P46094 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
XCR1P46094 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
XCR1P46094 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
XCR1P46094 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
XCR1P46094 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
XCR1P46094 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
XCR1P46094 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
XCR1P46094 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
XCR1P46094 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
XCR1P46094 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
XCR1P46094 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
XCR1P46094 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
XCR1P46094 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
XCR1P46094 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
XCR1P46094 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
XCR1P46094 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
XCR1P46094 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
XCR1P46094 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
XCR1P46094 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
XCR1P46094 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
XCR1P46094 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
XCR1P46094 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
XCR1P46094 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
XCR1P46094 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
XCR1P46094 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
XCR1P46094 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
XCR1P46094 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
XCR1P46094 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
XCR1P46094 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
XCR1P46094 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
XCR1P46094 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
XCR1P46094 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
XCR1P46094 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
XCR1P46094 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
XCR1P46094 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
XCR1P46094 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
XCR1P46094 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
XCR1P46094 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
XCR1P46094 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
XCR1P46094 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
XCR1P46094 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
XCR1P46094 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
XCR1P46094 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
XCR1P46094 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
XCR1P46094 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
XCR1P46094 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
XCR1P46094 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
XCR1P46094 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
XCR1P46094 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
XCR1P46094 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
XCR1P46094 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
XCR1P46094 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
XCR1P46094 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
XCR1P46094 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
XCR1P46094 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
XCR1P46094 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
XCR1P46094 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
XCR1P46094 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
XCR1P46094 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
XCR1P46094 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
XCR1P46094 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
XCR1P46094 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
XCR1P46094 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
XCR1P46094 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
XCR1P46094 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
XCR1P46094 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
XCR1P46094 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
XCR1P46094 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
XCR1P46094 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
XCR1P46094 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
XCR1P46094 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
XCR1P46094 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
XCR1P46094 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
XCR1P46094 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
XCR1P46094 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
XCR1P46094 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
XCR1P46094 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
XCR1P46094 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
XCR1P46094 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
XCR1P46094 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
XCR1P46094 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
XCR1P46094 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
XCR1P46094 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
XCR1P46094 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
XCR1P46094 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
XCR1P46094 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
XCR1P46094 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms