Protein–RNA interactions for Protein: P43353

ALDH3B1, Aldehyde dehydrogenase family 3 member B1, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH3B1P43353 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ALDH3B1P43353 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ALDH3B1P43353 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ALDH3B1P43353 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ALDH3B1P43353 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ALDH3B1P43353 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ALDH3B1P43353 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ALDH3B1P43353 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ALDH3B1P43353 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ALDH3B1P43353 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ALDH3B1P43353 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ALDH3B1P43353 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ALDH3B1P43353 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ALDH3B1P43353 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ALDH3B1P43353 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ALDH3B1P43353 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ALDH3B1P43353 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ALDH3B1P43353 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ALDH3B1P43353 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ALDH3B1P43353 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ALDH3B1P43353 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ALDH3B1P43353 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ALDH3B1P43353 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ALDH3B1P43353 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ALDH3B1P43353 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ALDH3B1P43353 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ALDH3B1P43353 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ALDH3B1P43353 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ALDH3B1P43353 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ALDH3B1P43353 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ALDH3B1P43353 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ALDH3B1P43353 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ALDH3B1P43353 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ALDH3B1P43353 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ALDH3B1P43353 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ALDH3B1P43353 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ALDH3B1P43353 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ALDH3B1P43353 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ALDH3B1P43353 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ALDH3B1P43353 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ALDH3B1P43353 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ALDH3B1P43353 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ALDH3B1P43353 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ALDH3B1P43353 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ALDH3B1P43353 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ALDH3B1P43353 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ALDH3B1P43353 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ALDH3B1P43353 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ALDH3B1P43353 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ALDH3B1P43353 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ALDH3B1P43353 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ALDH3B1P43353 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ALDH3B1P43353 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ALDH3B1P43353 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ALDH3B1P43353 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ALDH3B1P43353 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ALDH3B1P43353 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ALDH3B1P43353 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ALDH3B1P43353 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ALDH3B1P43353 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ALDH3B1P43353 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ALDH3B1P43353 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ALDH3B1P43353 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ALDH3B1P43353 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ALDH3B1P43353 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ALDH3B1P43353 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ALDH3B1P43353 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ALDH3B1P43353 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ALDH3B1P43353 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ALDH3B1P43353 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ALDH3B1P43353 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ALDH3B1P43353 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ALDH3B1P43353 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ALDH3B1P43353 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ALDH3B1P43353 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ALDH3B1P43353 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ALDH3B1P43353 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ALDH3B1P43353 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ALDH3B1P43353 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ALDH3B1P43353 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ALDH3B1P43353 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ALDH3B1P43353 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ALDH3B1P43353 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ALDH3B1P43353 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ALDH3B1P43353 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ALDH3B1P43353 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ALDH3B1P43353 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ALDH3B1P43353 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ALDH3B1P43353 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ALDH3B1P43353 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ALDH3B1P43353 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ALDH3B1P43353 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ALDH3B1P43353 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ALDH3B1P43353 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ALDH3B1P43353 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ALDH3B1P43353 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ALDH3B1P43353 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ALDH3B1P43353 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ALDH3B1P43353 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ALDH3B1P43353 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms