Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMPOP42166 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMPOP42166 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMPOP42166 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMPOP42166 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMPOP42166 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMPOP42166 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMPOP42166 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMPOP42166 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMPOP42166 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMPOP42166 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMPOP42166 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMPOP42166 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMPOP42166 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMPOP42166 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMPOP42166 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMPOP42166 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMPOP42166 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMPOP42166 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMPOP42166 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMPOP42166 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMPOP42166 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TMPOP42166 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMPOP42166 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMPOP42166 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMPOP42166 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMPOP42166 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMPOP42166 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMPOP42166 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMPOP42166 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMPOP42166 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMPOP42166 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMPOP42166 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMPOP42166 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMPOP42166 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMPOP42166 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMPOP42166 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMPOP42166 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMPOP42166 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TMPOP42166 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMPOP42166 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMPOP42166 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMPOP42166 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMPOP42166 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMPOP42166 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMPOP42166 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMPOP42166 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMPOP42166 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMPOP42166 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMPOP42166 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMPOP42166 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMPOP42166 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TMPOP42166 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TMPOP42166 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMPOP42166 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMPOP42166 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMPOP42166 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMPOP42166 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMPOP42166 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMPOP42166 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMPOP42166 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMPOP42166 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMPOP42166 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TMPOP42166 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMPOP42166 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMPOP42166 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMPOP42166 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMPOP42166 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TMPOP42166 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMPOP42166 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMPOP42166 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMPOP42166 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMPOP42166 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMPOP42166 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMPOP42166 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMPOP42166 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMPOP42166 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMPOP42166 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TMPOP42166 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TMPOP42166 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMPOP42166 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
TMPOP42166 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMPOP42166 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMPOP42166 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMPOP42166 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMPOP42166 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMPOP42166 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMPOP42166 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMPOP42166 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMPOP42166 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMPOP42166 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMPOP42166 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMPOP42166 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMPOP42166 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMPOP42166 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TMPOP42166 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMPOP42166 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMPOP42166 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMPOP42166 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMPOP42166 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms