Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PPARGP37231 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PPARGP37231 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PPARGP37231 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PPARGP37231 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PPARGP37231 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PPARGP37231 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PPARGP37231 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PPARGP37231 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PPARGP37231 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PPARGP37231 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.42
PPARGP37231 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PPARGP37231 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
PPARGP37231 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PPARGP37231 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.42
PPARGP37231 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PPARGP37231 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PPARGP37231 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PPARGP37231 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PPARGP37231 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PPARGP37231 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PPARGP37231 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PPARGP37231 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PPARGP37231 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PPARGP37231 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PPARGP37231 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PPARGP37231 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PPARGP37231 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PPARGP37231 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PPARGP37231 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PPARGP37231 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PPARGP37231 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PPARGP37231 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PPARGP37231 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PPARGP37231 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PPARGP37231 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PPARGP37231 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PPARGP37231 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PPARGP37231 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PPARGP37231 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PPARGP37231 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PPARGP37231 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PPARGP37231 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PPARGP37231 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PPARGP37231 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PPARGP37231 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PPARGP37231 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PPARGP37231 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PPARGP37231 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PPARGP37231 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PPARGP37231 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PPARGP37231 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PPARGP37231 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PPARGP37231 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PPARGP37231 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PPARGP37231 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PPARGP37231 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PPARGP37231 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PPARGP37231 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PPARGP37231 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PPARGP37231 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PPARGP37231 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PPARGP37231 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PPARGP37231 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PPARGP37231 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PPARGP37231 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PPARGP37231 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PPARGP37231 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PPARGP37231 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PPARGP37231 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PPARGP37231 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PPARGP37231 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PPARGP37231 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PPARGP37231 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PPARGP37231 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PPARGP37231 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PPARGP37231 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PPARGP37231 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PPARGP37231 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PPARGP37231 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PPARGP37231 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PPARGP37231 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PPARGP37231 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PPARGP37231 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PPARGP37231 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PPARGP37231 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PPARGP37231 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PPARGP37231 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PPARGP37231 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PPARGP37231 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PPARGP37231 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PPARGP37231 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PPARGP37231 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PPARGP37231 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PPARGP37231 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PPARGP37231 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PPARGP37231 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PPARGP37231 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PPARGP37231 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PPARGP37231 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms