Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2IP36954 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms