Protein–RNA interactions for Protein: P35321

SPRR1A, Cornifin-A, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRR1AP35321 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SPRR1AP35321 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SPRR1AP35321 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SPRR1AP35321 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SPRR1AP35321 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SPRR1AP35321 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SPRR1AP35321 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SPRR1AP35321 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
SPRR1AP35321 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SPRR1AP35321 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SPRR1AP35321 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SPRR1AP35321 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SPRR1AP35321 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SPRR1AP35321 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SPRR1AP35321 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SPRR1AP35321 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SPRR1AP35321 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SPRR1AP35321 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SPRR1AP35321 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SPRR1AP35321 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SPRR1AP35321 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SPRR1AP35321 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SPRR1AP35321 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SPRR1AP35321 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SPRR1AP35321 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SPRR1AP35321 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SPRR1AP35321 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SPRR1AP35321 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SPRR1AP35321 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SPRR1AP35321 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SPRR1AP35321 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SPRR1AP35321 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SPRR1AP35321 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SPRR1AP35321 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
SPRR1AP35321 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SPRR1AP35321 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SPRR1AP35321 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SPRR1AP35321 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
SPRR1AP35321 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SPRR1AP35321 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SPRR1AP35321 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SPRR1AP35321 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SPRR1AP35321 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SPRR1AP35321 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SPRR1AP35321 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SPRR1AP35321 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SPRR1AP35321 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SPRR1AP35321 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SPRR1AP35321 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SPRR1AP35321 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SPRR1AP35321 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SPRR1AP35321 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SPRR1AP35321 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SPRR1AP35321 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SPRR1AP35321 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
SPRR1AP35321 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SPRR1AP35321 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SPRR1AP35321 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SPRR1AP35321 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SPRR1AP35321 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SPRR1AP35321 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SPRR1AP35321 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SPRR1AP35321 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SPRR1AP35321 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SPRR1AP35321 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SPRR1AP35321 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SPRR1AP35321 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SPRR1AP35321 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SPRR1AP35321 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SPRR1AP35321 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SPRR1AP35321 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SPRR1AP35321 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SPRR1AP35321 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SPRR1AP35321 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SPRR1AP35321 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SPRR1AP35321 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SPRR1AP35321 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SPRR1AP35321 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SPRR1AP35321 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SPRR1AP35321 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
SPRR1AP35321 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SPRR1AP35321 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SPRR1AP35321 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SPRR1AP35321 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SPRR1AP35321 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SPRR1AP35321 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SPRR1AP35321 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
SPRR1AP35321 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SPRR1AP35321 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
SPRR1AP35321 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SPRR1AP35321 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
SPRR1AP35321 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SPRR1AP35321 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SPRR1AP35321 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SPRR1AP35321 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SPRR1AP35321 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SPRR1AP35321 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SPRR1AP35321 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SPRR1AP35321 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SPRR1AP35321 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms