Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms