Protein–RNA interactions for Protein: P32248

CCR7, C-C chemokine receptor type 7, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR7P32248 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCR7P32248 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCR7P32248 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCR7P32248 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCR7P32248 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCR7P32248 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCR7P32248 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCR7P32248 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCR7P32248 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCR7P32248 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCR7P32248 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCR7P32248 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCR7P32248 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCR7P32248 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCR7P32248 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCR7P32248 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCR7P32248 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCR7P32248 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCR7P32248 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCR7P32248 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCR7P32248 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCR7P32248 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCR7P32248 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCR7P32248 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCR7P32248 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCR7P32248 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCR7P32248 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCR7P32248 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCR7P32248 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCR7P32248 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCR7P32248 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCR7P32248 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCR7P32248 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCR7P32248 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCR7P32248 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCR7P32248 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCR7P32248 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCR7P32248 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCR7P32248 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCR7P32248 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CCR7P32248 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCR7P32248 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCR7P32248 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CCR7P32248 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCR7P32248 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCR7P32248 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CCR7P32248 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCR7P32248 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CCR7P32248 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCR7P32248 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCR7P32248 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCR7P32248 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCR7P32248 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCR7P32248 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCR7P32248 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCR7P32248 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCR7P32248 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCR7P32248 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCR7P32248 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCR7P32248 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCR7P32248 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CCR7P32248 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCR7P32248 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCR7P32248 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCR7P32248 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCR7P32248 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCR7P32248 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCR7P32248 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCR7P32248 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCR7P32248 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCR7P32248 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCR7P32248 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCR7P32248 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCR7P32248 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCR7P32248 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCR7P32248 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CCR7P32248 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCR7P32248 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCR7P32248 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCR7P32248 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCR7P32248 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CCR7P32248 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCR7P32248 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCR7P32248 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCR7P32248 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCR7P32248 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCR7P32248 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CCR7P32248 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCR7P32248 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCR7P32248 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCR7P32248 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCR7P32248 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCR7P32248 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCR7P32248 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCR7P32248 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCR7P32248 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCR7P32248 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCR7P32248 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCR7P32248 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCR7P32248 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms