Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCKARP32238 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCKARP32238 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCKARP32238 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCKARP32238 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCKARP32238 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCKARP32238 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCKARP32238 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCKARP32238 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCKARP32238 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCKARP32238 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCKARP32238 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCKARP32238 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCKARP32238 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCKARP32238 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCKARP32238 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCKARP32238 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCKARP32238 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCKARP32238 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCKARP32238 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCKARP32238 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCKARP32238 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCKARP32238 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCKARP32238 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
CCKARP32238 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCKARP32238 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCKARP32238 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCKARP32238 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCKARP32238 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCKARP32238 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCKARP32238 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCKARP32238 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCKARP32238 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCKARP32238 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCKARP32238 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCKARP32238 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCKARP32238 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCKARP32238 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCKARP32238 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCKARP32238 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCKARP32238 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCKARP32238 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCKARP32238 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCKARP32238 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCKARP32238 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCKARP32238 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCKARP32238 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCKARP32238 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCKARP32238 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCKARP32238 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCKARP32238 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCKARP32238 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCKARP32238 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCKARP32238 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCKARP32238 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCKARP32238 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCKARP32238 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCKARP32238 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCKARP32238 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCKARP32238 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCKARP32238 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCKARP32238 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCKARP32238 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCKARP32238 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCKARP32238 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCKARP32238 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCKARP32238 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCKARP32238 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCKARP32238 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCKARP32238 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCKARP32238 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCKARP32238 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCKARP32238 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCKARP32238 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCKARP32238 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCKARP32238 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCKARP32238 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCKARP32238 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCKARP32238 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCKARP32238 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCKARP32238 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCKARP32238 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCKARP32238 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCKARP32238 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCKARP32238 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCKARP32238 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCKARP32238 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCKARP32238 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCKARP32238 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CCKARP32238 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCKARP32238 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCKARP32238 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCKARP32238 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CCKARP32238 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCKARP32238 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCKARP32238 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCKARP32238 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCKARP32238 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCKARP32238 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCKARP32238 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms