Protein–RNA interactions for Protein: P31150

GDI1, Rab GDP dissociation inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDI1P31150 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GDI1P31150 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GDI1P31150 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GDI1P31150 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GDI1P31150 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GDI1P31150 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GDI1P31150 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GDI1P31150 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GDI1P31150 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GDI1P31150 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GDI1P31150 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GDI1P31150 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GDI1P31150 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GDI1P31150 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GDI1P31150 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GDI1P31150 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GDI1P31150 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GDI1P31150 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GDI1P31150 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GDI1P31150 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GDI1P31150 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GDI1P31150 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GDI1P31150 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GDI1P31150 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GDI1P31150 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GDI1P31150 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GDI1P31150 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GDI1P31150 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GDI1P31150 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GDI1P31150 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GDI1P31150 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GDI1P31150 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GDI1P31150 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GDI1P31150 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GDI1P31150 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GDI1P31150 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GDI1P31150 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GDI1P31150 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GDI1P31150 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GDI1P31150 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GDI1P31150 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GDI1P31150 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GDI1P31150 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GDI1P31150 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GDI1P31150 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GDI1P31150 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GDI1P31150 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GDI1P31150 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GDI1P31150 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GDI1P31150 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GDI1P31150 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GDI1P31150 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GDI1P31150 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GDI1P31150 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GDI1P31150 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GDI1P31150 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GDI1P31150 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GDI1P31150 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GDI1P31150 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GDI1P31150 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GDI1P31150 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GDI1P31150 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GDI1P31150 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GDI1P31150 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GDI1P31150 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GDI1P31150 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GDI1P31150 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GDI1P31150 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GDI1P31150 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GDI1P31150 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GDI1P31150 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GDI1P31150 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GDI1P31150 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GDI1P31150 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GDI1P31150 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GDI1P31150 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GDI1P31150 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GDI1P31150 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GDI1P31150 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GDI1P31150 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GDI1P31150 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GDI1P31150 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GDI1P31150 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GDI1P31150 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GDI1P31150 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GDI1P31150 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GDI1P31150 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GDI1P31150 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GDI1P31150 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GDI1P31150 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GDI1P31150 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GDI1P31150 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GDI1P31150 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GDI1P31150 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GDI1P31150 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GDI1P31150 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GDI1P31150 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GDI1P31150 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GDI1P31150 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GDI1P31150 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms