Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CASP1P29466 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CASP1P29466 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CASP1P29466 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CASP1P29466 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CASP1P29466 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CASP1P29466 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CASP1P29466 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CASP1P29466 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CASP1P29466 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CASP1P29466 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CASP1P29466 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CASP1P29466 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CASP1P29466 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CASP1P29466 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CASP1P29466 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CASP1P29466 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CASP1P29466 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CASP1P29466 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CASP1P29466 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CASP1P29466 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CASP1P29466 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CASP1P29466 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CASP1P29466 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CASP1P29466 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CASP1P29466 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CASP1P29466 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CASP1P29466 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CASP1P29466 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CASP1P29466 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CASP1P29466 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CASP1P29466 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CASP1P29466 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CASP1P29466 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CASP1P29466 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CASP1P29466 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CASP1P29466 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CASP1P29466 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CASP1P29466 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CASP1P29466 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CASP1P29466 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CASP1P29466 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CASP1P29466 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CASP1P29466 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CASP1P29466 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CASP1P29466 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CASP1P29466 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CASP1P29466 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CASP1P29466 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CASP1P29466 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CASP1P29466 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CASP1P29466 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CASP1P29466 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CASP1P29466 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CASP1P29466 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CASP1P29466 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CASP1P29466 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CASP1P29466 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CASP1P29466 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CASP1P29466 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CASP1P29466 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CASP1P29466 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CASP1P29466 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CASP1P29466 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CASP1P29466 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CASP1P29466 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CASP1P29466 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CASP1P29466 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CASP1P29466 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CASP1P29466 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CASP1P29466 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CASP1P29466 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CASP1P29466 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CASP1P29466 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CASP1P29466 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CASP1P29466 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CASP1P29466 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CASP1P29466 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CASP1P29466 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CASP1P29466 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CASP1P29466 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CASP1P29466 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CASP1P29466 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CASP1P29466 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CASP1P29466 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CASP1P29466 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CASP1P29466 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CASP1P29466 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CASP1P29466 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CASP1P29466 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CASP1P29466 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CASP1P29466 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CASP1P29466 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CASP1P29466 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CASP1P29466 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CASP1P29466 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CASP1P29466 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CASP1P29466 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CASP1P29466 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CASP1P29466 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms