Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms