Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMB5P28074 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms