Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms