Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMA3P25788 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms