Protein–RNA interactions for Protein: P21757

MSR1, Macrophage scavenger receptor types I and II, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSR1P21757 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MSR1P21757 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MSR1P21757 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MSR1P21757 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MSR1P21757 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MSR1P21757 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MSR1P21757 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MSR1P21757 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MSR1P21757 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MSR1P21757 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MSR1P21757 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MSR1P21757 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MSR1P21757 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MSR1P21757 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MSR1P21757 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MSR1P21757 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MSR1P21757 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MSR1P21757 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MSR1P21757 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MSR1P21757 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MSR1P21757 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MSR1P21757 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MSR1P21757 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSR1P21757 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSR1P21757 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSR1P21757 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSR1P21757 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSR1P21757 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSR1P21757 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSR1P21757 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSR1P21757 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSR1P21757 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSR1P21757 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSR1P21757 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSR1P21757 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSR1P21757 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MSR1P21757 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSR1P21757 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSR1P21757 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSR1P21757 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSR1P21757 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSR1P21757 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSR1P21757 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSR1P21757 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSR1P21757 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSR1P21757 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MSR1P21757 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MSR1P21757 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MSR1P21757 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSR1P21757 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSR1P21757 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSR1P21757 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSR1P21757 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSR1P21757 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSR1P21757 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSR1P21757 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSR1P21757 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSR1P21757 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSR1P21757 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSR1P21757 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSR1P21757 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSR1P21757 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MSR1P21757 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSR1P21757 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSR1P21757 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSR1P21757 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MSR1P21757 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MSR1P21757 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MSR1P21757 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MSR1P21757 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MSR1P21757 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MSR1P21757 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MSR1P21757 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MSR1P21757 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MSR1P21757 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MSR1P21757 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MSR1P21757 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MSR1P21757 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MSR1P21757 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MSR1P21757 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MSR1P21757 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MSR1P21757 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MSR1P21757 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MSR1P21757 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MSR1P21757 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MSR1P21757 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MSR1P21757 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MSR1P21757 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MSR1P21757 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MSR1P21757 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MSR1P21757 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MSR1P21757 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MSR1P21757 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MSR1P21757 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MSR1P21757 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MSR1P21757 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MSR1P21757 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MSR1P21757 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MSR1P21757 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MSR1P21757 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms