Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD247P20963 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD247P20963 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD247P20963 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD247P20963 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD247P20963 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD247P20963 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD247P20963 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD247P20963 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD247P20963 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD247P20963 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD247P20963 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD247P20963 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD247P20963 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD247P20963 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD247P20963 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD247P20963 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD247P20963 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD247P20963 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD247P20963 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD247P20963 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD247P20963 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD247P20963 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD247P20963 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD247P20963 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD247P20963 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD247P20963 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD247P20963 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD247P20963 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD247P20963 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD247P20963 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD247P20963 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD247P20963 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD247P20963 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD247P20963 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD247P20963 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD247P20963 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD247P20963 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD247P20963 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD247P20963 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD247P20963 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD247P20963 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD247P20963 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD247P20963 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD247P20963 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CD247P20963 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CD247P20963 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD247P20963 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD247P20963 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD247P20963 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD247P20963 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD247P20963 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD247P20963 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD247P20963 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD247P20963 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD247P20963 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD247P20963 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD247P20963 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD247P20963 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD247P20963 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD247P20963 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD247P20963 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD247P20963 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD247P20963 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD247P20963 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD247P20963 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD247P20963 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CD247P20963 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD247P20963 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD247P20963 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD247P20963 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD247P20963 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD247P20963 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD247P20963 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD247P20963 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD247P20963 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CD247P20963 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD247P20963 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CD247P20963 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD247P20963 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD247P20963 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD247P20963 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CD247P20963 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CD247P20963 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CD247P20963 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CD247P20963 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CD247P20963 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CD247P20963 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CD247P20963 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CD247P20963 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CD247P20963 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CD247P20963 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CD247P20963 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CD247P20963 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CD247P20963 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD247P20963 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD247P20963 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD247P20963 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD247P20963 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD247P20963 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms