Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EFNA1P20827 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms