Protein–RNA interactions for Protein: P20783

NTF3, Neurotrophin-3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF3P20783 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NTF3P20783 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
NTF3P20783 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NTF3P20783 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NTF3P20783 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NTF3P20783 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NTF3P20783 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NTF3P20783 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NTF3P20783 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NTF3P20783 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NTF3P20783 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NTF3P20783 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NTF3P20783 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NTF3P20783 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NTF3P20783 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NTF3P20783 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NTF3P20783 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NTF3P20783 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NTF3P20783 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NTF3P20783 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NTF3P20783 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NTF3P20783 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NTF3P20783 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NTF3P20783 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NTF3P20783 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NTF3P20783 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NTF3P20783 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NTF3P20783 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NTF3P20783 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NTF3P20783 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NTF3P20783 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NTF3P20783 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NTF3P20783 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
NTF3P20783 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NTF3P20783 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NTF3P20783 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NTF3P20783 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NTF3P20783 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NTF3P20783 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NTF3P20783 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NTF3P20783 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NTF3P20783 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NTF3P20783 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NTF3P20783 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NTF3P20783 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NTF3P20783 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NTF3P20783 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NTF3P20783 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NTF3P20783 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
NTF3P20783 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NTF3P20783 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NTF3P20783 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NTF3P20783 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
NTF3P20783 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NTF3P20783 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NTF3P20783 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NTF3P20783 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NTF3P20783 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NTF3P20783 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NTF3P20783 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NTF3P20783 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NTF3P20783 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NTF3P20783 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NTF3P20783 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NTF3P20783 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NTF3P20783 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NTF3P20783 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NTF3P20783 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NTF3P20783 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NTF3P20783 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NTF3P20783 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NTF3P20783 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NTF3P20783 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NTF3P20783 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NTF3P20783 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NTF3P20783 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NTF3P20783 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NTF3P20783 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NTF3P20783 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NTF3P20783 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NTF3P20783 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NTF3P20783 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NTF3P20783 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NTF3P20783 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NTF3P20783 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NTF3P20783 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NTF3P20783 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NTF3P20783 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NTF3P20783 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NTF3P20783 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NTF3P20783 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NTF3P20783 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NTF3P20783 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NTF3P20783 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
NTF3P20783 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NTF3P20783 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NTF3P20783 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NTF3P20783 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NTF3P20783 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NTF3P20783 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms