Protein–RNA interactions for Protein: P18858

LIG1, DNA ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIG1P18858 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LIG1P18858 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LIG1P18858 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LIG1P18858 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LIG1P18858 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LIG1P18858 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LIG1P18858 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LIG1P18858 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LIG1P18858 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LIG1P18858 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LIG1P18858 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LIG1P18858 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LIG1P18858 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LIG1P18858 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LIG1P18858 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
LIG1P18858 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LIG1P18858 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LIG1P18858 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LIG1P18858 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LIG1P18858 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LIG1P18858 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LIG1P18858 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LIG1P18858 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
LIG1P18858 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LIG1P18858 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LIG1P18858 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LIG1P18858 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LIG1P18858 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LIG1P18858 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LIG1P18858 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LIG1P18858 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LIG1P18858 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LIG1P18858 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LIG1P18858 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LIG1P18858 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LIG1P18858 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LIG1P18858 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LIG1P18858 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LIG1P18858 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LIG1P18858 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LIG1P18858 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LIG1P18858 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LIG1P18858 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LIG1P18858 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LIG1P18858 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LIG1P18858 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LIG1P18858 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LIG1P18858 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LIG1P18858 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LIG1P18858 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LIG1P18858 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LIG1P18858 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LIG1P18858 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LIG1P18858 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LIG1P18858 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
LIG1P18858 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LIG1P18858 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LIG1P18858 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LIG1P18858 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LIG1P18858 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LIG1P18858 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LIG1P18858 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LIG1P18858 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LIG1P18858 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LIG1P18858 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LIG1P18858 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LIG1P18858 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
LIG1P18858 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
LIG1P18858 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
LIG1P18858 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LIG1P18858 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LIG1P18858 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LIG1P18858 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LIG1P18858 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LIG1P18858 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LIG1P18858 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LIG1P18858 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LIG1P18858 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LIG1P18858 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LIG1P18858 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
LIG1P18858 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LIG1P18858 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
LIG1P18858 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LIG1P18858 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LIG1P18858 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LIG1P18858 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LIG1P18858 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LIG1P18858 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LIG1P18858 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LIG1P18858 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LIG1P18858 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LIG1P18858 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LIG1P18858 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LIG1P18858 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LIG1P18858 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LIG1P18858 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LIG1P18858 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LIG1P18858 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LIG1P18858 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LIG1P18858 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms