Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTPS1P17812 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTPS1P17812 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTPS1P17812 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTPS1P17812 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTPS1P17812 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTPS1P17812 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTPS1P17812 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTPS1P17812 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTPS1P17812 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTPS1P17812 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTPS1P17812 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTPS1P17812 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CTPS1P17812 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CTPS1P17812 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTPS1P17812 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTPS1P17812 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTPS1P17812 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTPS1P17812 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CTPS1P17812 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTPS1P17812 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTPS1P17812 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CTPS1P17812 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CTPS1P17812 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTPS1P17812 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTPS1P17812 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTPS1P17812 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTPS1P17812 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTPS1P17812 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTPS1P17812 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTPS1P17812 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTPS1P17812 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTPS1P17812 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTPS1P17812 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTPS1P17812 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTPS1P17812 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTPS1P17812 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTPS1P17812 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTPS1P17812 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTPS1P17812 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTPS1P17812 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTPS1P17812 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTPS1P17812 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTPS1P17812 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTPS1P17812 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTPS1P17812 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTPS1P17812 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTPS1P17812 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTPS1P17812 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTPS1P17812 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTPS1P17812 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTPS1P17812 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CTPS1P17812 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CTPS1P17812 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTPS1P17812 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CTPS1P17812 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CTPS1P17812 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTPS1P17812 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTPS1P17812 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTPS1P17812 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTPS1P17812 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTPS1P17812 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTPS1P17812 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTPS1P17812 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTPS1P17812 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTPS1P17812 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTPS1P17812 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTPS1P17812 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTPS1P17812 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTPS1P17812 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTPS1P17812 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTPS1P17812 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTPS1P17812 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTPS1P17812 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTPS1P17812 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTPS1P17812 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTPS1P17812 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTPS1P17812 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTPS1P17812 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTPS1P17812 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTPS1P17812 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTPS1P17812 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTPS1P17812 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTPS1P17812 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTPS1P17812 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTPS1P17812 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTPS1P17812 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTPS1P17812 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CTPS1P17812 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTPS1P17812 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTPS1P17812 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CTPS1P17812 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTPS1P17812 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTPS1P17812 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTPS1P17812 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CTPS1P17812 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTPS1P17812 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTPS1P17812 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTPS1P17812 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTPS1P17812 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms