Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB9P17482 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms