Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
EPCAMP16422 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EPCAMP16422 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EPCAMP16422 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EPCAMP16422 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EPCAMP16422 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EPCAMP16422 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EPCAMP16422 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EPCAMP16422 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EPCAMP16422 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EPCAMP16422 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EPCAMP16422 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EPCAMP16422 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EPCAMP16422 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EPCAMP16422 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EPCAMP16422 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EPCAMP16422 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EPCAMP16422 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EPCAMP16422 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EPCAMP16422 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EPCAMP16422 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EPCAMP16422 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EPCAMP16422 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
EPCAMP16422 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EPCAMP16422 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EPCAMP16422 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EPCAMP16422 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EPCAMP16422 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EPCAMP16422 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
EPCAMP16422 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EPCAMP16422 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EPCAMP16422 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
EPCAMP16422 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EPCAMP16422 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EPCAMP16422 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EPCAMP16422 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EPCAMP16422 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EPCAMP16422 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EPCAMP16422 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EPCAMP16422 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EPCAMP16422 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EPCAMP16422 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EPCAMP16422 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EPCAMP16422 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EPCAMP16422 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EPCAMP16422 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EPCAMP16422 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EPCAMP16422 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EPCAMP16422 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EPCAMP16422 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EPCAMP16422 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EPCAMP16422 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EPCAMP16422 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EPCAMP16422 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EPCAMP16422 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EPCAMP16422 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EPCAMP16422 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EPCAMP16422 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
EPCAMP16422 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EPCAMP16422 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EPCAMP16422 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EPCAMP16422 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EPCAMP16422 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EPCAMP16422 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EPCAMP16422 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EPCAMP16422 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EPCAMP16422 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EPCAMP16422 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EPCAMP16422 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EPCAMP16422 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EPCAMP16422 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EPCAMP16422 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EPCAMP16422 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EPCAMP16422 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EPCAMP16422 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EPCAMP16422 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
EPCAMP16422 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
EPCAMP16422 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
EPCAMP16422 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EPCAMP16422 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EPCAMP16422 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EPCAMP16422 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EPCAMP16422 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EPCAMP16422 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EPCAMP16422 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EPCAMP16422 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EPCAMP16422 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EPCAMP16422 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EPCAMP16422 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EPCAMP16422 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EPCAMP16422 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EPCAMP16422 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EPCAMP16422 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EPCAMP16422 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
EPCAMP16422 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EPCAMP16422 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EPCAMP16422 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EPCAMP16422 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EPCAMP16422 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EPCAMP16422 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms