Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ITGA4P13612 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ITGA4P13612 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ITGA4P13612 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ITGA4P13612 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ITGA4P13612 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ITGA4P13612 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ITGA4P13612 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ITGA4P13612 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ITGA4P13612 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ITGA4P13612 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ITGA4P13612 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ITGA4P13612 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ITGA4P13612 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ITGA4P13612 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ITGA4P13612 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ITGA4P13612 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ITGA4P13612 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ITGA4P13612 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ITGA4P13612 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ITGA4P13612 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ITGA4P13612 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ITGA4P13612 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ITGA4P13612 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ITGA4P13612 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ITGA4P13612 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ITGA4P13612 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ITGA4P13612 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ITGA4P13612 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ITGA4P13612 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ITGA4P13612 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ITGA4P13612 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ITGA4P13612 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms