Protein–RNA interactions for Protein: P10075

GLI4, Zinc finger protein GLI4, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI4P10075 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GLI4P10075 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GLI4P10075 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GLI4P10075 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GLI4P10075 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GLI4P10075 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GLI4P10075 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GLI4P10075 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GLI4P10075 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GLI4P10075 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GLI4P10075 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GLI4P10075 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GLI4P10075 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GLI4P10075 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GLI4P10075 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GLI4P10075 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GLI4P10075 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GLI4P10075 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GLI4P10075 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GLI4P10075 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GLI4P10075 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GLI4P10075 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GLI4P10075 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GLI4P10075 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GLI4P10075 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GLI4P10075 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GLI4P10075 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GLI4P10075 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GLI4P10075 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GLI4P10075 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GLI4P10075 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GLI4P10075 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GLI4P10075 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GLI4P10075 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GLI4P10075 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GLI4P10075 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GLI4P10075 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GLI4P10075 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GLI4P10075 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GLI4P10075 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GLI4P10075 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GLI4P10075 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GLI4P10075 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GLI4P10075 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GLI4P10075 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GLI4P10075 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GLI4P10075 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GLI4P10075 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GLI4P10075 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GLI4P10075 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GLI4P10075 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GLI4P10075 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GLI4P10075 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GLI4P10075 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GLI4P10075 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GLI4P10075 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GLI4P10075 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GLI4P10075 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GLI4P10075 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GLI4P10075 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GLI4P10075 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GLI4P10075 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GLI4P10075 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GLI4P10075 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GLI4P10075 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GLI4P10075 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GLI4P10075 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GLI4P10075 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GLI4P10075 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GLI4P10075 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GLI4P10075 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GLI4P10075 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GLI4P10075 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GLI4P10075 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GLI4P10075 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GLI4P10075 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GLI4P10075 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GLI4P10075 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GLI4P10075 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GLI4P10075 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GLI4P10075 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GLI4P10075 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GLI4P10075 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GLI4P10075 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GLI4P10075 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GLI4P10075 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GLI4P10075 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GLI4P10075 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GLI4P10075 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GLI4P10075 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GLI4P10075 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GLI4P10075 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GLI4P10075 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GLI4P10075 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GLI4P10075 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GLI4P10075 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GLI4P10075 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GLI4P10075 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GLI4P10075 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GLI4P10075 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms