Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHOP08100 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHOP08100 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHOP08100 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHOP08100 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RHOP08100 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RHOP08100 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHOP08100 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHOP08100 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHOP08100 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHOP08100 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHOP08100 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHOP08100 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RHOP08100 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHOP08100 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHOP08100 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHOP08100 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHOP08100 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHOP08100 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHOP08100 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RHOP08100 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RHOP08100 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RHOP08100 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RHOP08100 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RHOP08100 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RHOP08100 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RHOP08100 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RHOP08100 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RHOP08100 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RHOP08100 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RHOP08100 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RHOP08100 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RHOP08100 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RHOP08100 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RHOP08100 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RHOP08100 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RHOP08100 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RHOP08100 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RHOP08100 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RHOP08100 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RHOP08100 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RHOP08100 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RHOP08100 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RHOP08100 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RHOP08100 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RHOP08100 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RHOP08100 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RHOP08100 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RHOP08100 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RHOP08100 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RHOP08100 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RHOP08100 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RHOP08100 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RHOP08100 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RHOP08100 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RHOP08100 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RHOP08100 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
RHOP08100 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHOP08100 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHOP08100 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHOP08100 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHOP08100 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHOP08100 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHOP08100 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHOP08100 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHOP08100 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHOP08100 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHOP08100 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHOP08100 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHOP08100 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHOP08100 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHOP08100 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHOP08100 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHOP08100 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHOP08100 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHOP08100 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RHOP08100 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHOP08100 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHOP08100 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHOP08100 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHOP08100 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHOP08100 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHOP08100 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHOP08100 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHOP08100 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHOP08100 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHOP08100 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHOP08100 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHOP08100 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHOP08100 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHOP08100 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHOP08100 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHOP08100 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHOP08100 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHOP08100 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHOP08100 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RHOP08100 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHOP08100 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RHOP08100 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RHOP08100 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms