Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGAVP06756 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms