Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZBED1O96006 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZBED1O96006 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ZBED1O96006 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZBED1O96006 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZBED1O96006 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZBED1O96006 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZBED1O96006 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZBED1O96006 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZBED1O96006 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZBED1O96006 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
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