Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms