Protein–RNA interactions for Protein: O94888

UBXN7, UBX domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN7O94888 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBXN7O94888 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBXN7O94888 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBXN7O94888 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
UBXN7O94888 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
UBXN7O94888 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBXN7O94888 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN7O94888 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN7O94888 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN7O94888 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN7O94888 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN7O94888 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN7O94888 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN7O94888 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN7O94888 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN7O94888 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN7O94888 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN7O94888 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN7O94888 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN7O94888 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN7O94888 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN7O94888 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN7O94888 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN7O94888 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN7O94888 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN7O94888 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN7O94888 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN7O94888 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN7O94888 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN7O94888 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN7O94888 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN7O94888 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN7O94888 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN7O94888 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN7O94888 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN7O94888 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN7O94888 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN7O94888 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN7O94888 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN7O94888 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN7O94888 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN7O94888 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN7O94888 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN7O94888 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN7O94888 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN7O94888 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN7O94888 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN7O94888 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN7O94888 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN7O94888 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN7O94888 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN7O94888 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN7O94888 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN7O94888 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN7O94888 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN7O94888 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN7O94888 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN7O94888 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN7O94888 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN7O94888 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN7O94888 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN7O94888 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN7O94888 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN7O94888 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN7O94888 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN7O94888 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN7O94888 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN7O94888 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN7O94888 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN7O94888 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN7O94888 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN7O94888 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN7O94888 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN7O94888 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN7O94888 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN7O94888 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN7O94888 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN7O94888 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN7O94888 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN7O94888 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN7O94888 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN7O94888 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN7O94888 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN7O94888 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN7O94888 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN7O94888 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBXN7O94888 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBXN7O94888 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBXN7O94888 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBXN7O94888 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBXN7O94888 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBXN7O94888 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBXN7O94888 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBXN7O94888 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBXN7O94888 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBXN7O94888 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBXN7O94888 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
UBXN7O94888 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBXN7O94888 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBXN7O94888 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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