Protein–RNA interactions for Protein: O76031

CLPX, ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit clpX-like, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPXO76031 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLPXO76031 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLPXO76031 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLPXO76031 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLPXO76031 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLPXO76031 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLPXO76031 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLPXO76031 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLPXO76031 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLPXO76031 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLPXO76031 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLPXO76031 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLPXO76031 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLPXO76031 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLPXO76031 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLPXO76031 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLPXO76031 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLPXO76031 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLPXO76031 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLPXO76031 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLPXO76031 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLPXO76031 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLPXO76031 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLPXO76031 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLPXO76031 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLPXO76031 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLPXO76031 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLPXO76031 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLPXO76031 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CLPXO76031 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLPXO76031 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLPXO76031 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLPXO76031 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLPXO76031 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLPXO76031 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLPXO76031 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLPXO76031 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CLPXO76031 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLPXO76031 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLPXO76031 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLPXO76031 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CLPXO76031 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLPXO76031 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLPXO76031 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLPXO76031 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLPXO76031 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLPXO76031 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLPXO76031 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLPXO76031 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLPXO76031 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLPXO76031 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLPXO76031 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLPXO76031 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLPXO76031 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLPXO76031 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLPXO76031 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLPXO76031 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLPXO76031 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLPXO76031 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLPXO76031 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLPXO76031 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLPXO76031 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLPXO76031 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CLPXO76031 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLPXO76031 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLPXO76031 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLPXO76031 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLPXO76031 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLPXO76031 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLPXO76031 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLPXO76031 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLPXO76031 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLPXO76031 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLPXO76031 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLPXO76031 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLPXO76031 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLPXO76031 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLPXO76031 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLPXO76031 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLPXO76031 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CLPXO76031 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLPXO76031 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLPXO76031 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLPXO76031 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLPXO76031 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLPXO76031 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLPXO76031 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLPXO76031 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLPXO76031 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLPXO76031 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLPXO76031 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLPXO76031 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLPXO76031 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLPXO76031 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLPXO76031 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLPXO76031 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLPXO76031 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLPXO76031 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLPXO76031 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLPXO76031 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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