Protein–RNA interactions for Protein: O60361

NME2P1, Putative nucleoside diphosphate kinase, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME2P1O60361 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NME2P1O60361 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NME2P1O60361 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NME2P1O60361 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NME2P1O60361 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NME2P1O60361 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NME2P1O60361 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NME2P1O60361 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NME2P1O60361 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NME2P1O60361 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NME2P1O60361 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME2P1O60361 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME2P1O60361 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME2P1O60361 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME2P1O60361 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME2P1O60361 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME2P1O60361 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NME2P1O60361 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME2P1O60361 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME2P1O60361 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME2P1O60361 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME2P1O60361 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME2P1O60361 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME2P1O60361 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME2P1O60361 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME2P1O60361 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME2P1O60361 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME2P1O60361 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME2P1O60361 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NME2P1O60361 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME2P1O60361 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME2P1O60361 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME2P1O60361 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME2P1O60361 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME2P1O60361 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME2P1O60361 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME2P1O60361 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME2P1O60361 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME2P1O60361 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME2P1O60361 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME2P1O60361 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME2P1O60361 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME2P1O60361 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NME2P1O60361 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME2P1O60361 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME2P1O60361 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME2P1O60361 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME2P1O60361 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME2P1O60361 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME2P1O60361 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME2P1O60361 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME2P1O60361 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME2P1O60361 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME2P1O60361 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME2P1O60361 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME2P1O60361 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME2P1O60361 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME2P1O60361 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME2P1O60361 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME2P1O60361 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME2P1O60361 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME2P1O60361 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME2P1O60361 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME2P1O60361 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME2P1O60361 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME2P1O60361 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME2P1O60361 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NME2P1O60361 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME2P1O60361 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME2P1O60361 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME2P1O60361 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME2P1O60361 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME2P1O60361 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME2P1O60361 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NME2P1O60361 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME2P1O60361 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME2P1O60361 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME2P1O60361 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME2P1O60361 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME2P1O60361 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME2P1O60361 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME2P1O60361 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME2P1O60361 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME2P1O60361 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME2P1O60361 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME2P1O60361 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME2P1O60361 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME2P1O60361 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME2P1O60361 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME2P1O60361 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME2P1O60361 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME2P1O60361 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME2P1O60361 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME2P1O60361 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NME2P1O60361 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NME2P1O60361 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NME2P1O60361 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NME2P1O60361 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NME2P1O60361 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NME2P1O60361 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms