Protein–RNA interactions for Protein: O43526

KCNQ2, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 2, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ2O43526 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNQ2O43526 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNQ2O43526 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNQ2O43526 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNQ2O43526 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNQ2O43526 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNQ2O43526 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNQ2O43526 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNQ2O43526 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNQ2O43526 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNQ2O43526 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNQ2O43526 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNQ2O43526 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNQ2O43526 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNQ2O43526 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNQ2O43526 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNQ2O43526 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNQ2O43526 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNQ2O43526 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNQ2O43526 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNQ2O43526 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNQ2O43526 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNQ2O43526 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNQ2O43526 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNQ2O43526 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNQ2O43526 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNQ2O43526 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNQ2O43526 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNQ2O43526 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNQ2O43526 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNQ2O43526 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNQ2O43526 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNQ2O43526 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNQ2O43526 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNQ2O43526 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNQ2O43526 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNQ2O43526 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNQ2O43526 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNQ2O43526 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNQ2O43526 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNQ2O43526 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNQ2O43526 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNQ2O43526 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNQ2O43526 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNQ2O43526 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNQ2O43526 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNQ2O43526 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNQ2O43526 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNQ2O43526 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNQ2O43526 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNQ2O43526 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNQ2O43526 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNQ2O43526 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNQ2O43526 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNQ2O43526 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNQ2O43526 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNQ2O43526 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNQ2O43526 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNQ2O43526 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNQ2O43526 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNQ2O43526 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNQ2O43526 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNQ2O43526 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNQ2O43526 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNQ2O43526 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNQ2O43526 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNQ2O43526 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNQ2O43526 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNQ2O43526 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNQ2O43526 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNQ2O43526 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNQ2O43526 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNQ2O43526 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNQ2O43526 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNQ2O43526 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNQ2O43526 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNQ2O43526 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNQ2O43526 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNQ2O43526 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNQ2O43526 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNQ2O43526 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNQ2O43526 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNQ2O43526 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNQ2O43526 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNQ2O43526 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNQ2O43526 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNQ2O43526 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNQ2O43526 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNQ2O43526 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNQ2O43526 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNQ2O43526 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNQ2O43526 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNQ2O43526 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNQ2O43526 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNQ2O43526 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNQ2O43526 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNQ2O43526 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNQ2O43526 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNQ2O43526 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNQ2O43526 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms