Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
APAF1O14727 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
APAF1O14727 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
APAF1O14727 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
APAF1O14727 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
APAF1O14727 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
APAF1O14727 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
APAF1O14727 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
APAF1O14727 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
APAF1O14727 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
APAF1O14727 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
APAF1O14727 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
APAF1O14727 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
APAF1O14727 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
APAF1O14727 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
APAF1O14727 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
APAF1O14727 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
APAF1O14727 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
APAF1O14727 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
APAF1O14727 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
APAF1O14727 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
APAF1O14727 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
APAF1O14727 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
APAF1O14727 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
APAF1O14727 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
APAF1O14727 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
APAF1O14727 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
APAF1O14727 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
APAF1O14727 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
APAF1O14727 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
APAF1O14727 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
APAF1O14727 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
APAF1O14727 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
APAF1O14727 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
APAF1O14727 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
APAF1O14727 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
APAF1O14727 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
APAF1O14727 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
APAF1O14727 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
APAF1O14727 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
APAF1O14727 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
APAF1O14727 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
APAF1O14727 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
APAF1O14727 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC23■■□□□ 1.27
APAF1O14727 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
APAF1O14727 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC23■■□□□ 1.27
APAF1O14727 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
APAF1O14727 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
APAF1O14727 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC23■■□□□ 1.27
APAF1O14727 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
APAF1O14727 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC23■■□□□ 1.27
APAF1O14727 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
APAF1O14727 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
APAF1O14727 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
APAF1O14727 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
APAF1O14727 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
APAF1O14727 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
APAF1O14727 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC23■■□□□ 1.27
APAF1O14727 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
APAF1O14727 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
APAF1O14727 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
APAF1O14727 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
APAF1O14727 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
APAF1O14727 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
APAF1O14727 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
APAF1O14727 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
APAF1O14727 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
APAF1O14727 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
APAF1O14727 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
APAF1O14727 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
APAF1O14727 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
APAF1O14727 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
APAF1O14727 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
APAF1O14727 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
APAF1O14727 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
APAF1O14727 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
APAF1O14727 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
APAF1O14727 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
APAF1O14727 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
APAF1O14727 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
APAF1O14727 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
APAF1O14727 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
APAF1O14727 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
APAF1O14727 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
APAF1O14727 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
APAF1O14727 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
APAF1O14727 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
APAF1O14727 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
APAF1O14727 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
APAF1O14727 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
APAF1O14727 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
APAF1O14727 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
APAF1O14727 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
APAF1O14727 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
APAF1O14727 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
APAF1O14727 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
APAF1O14727 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
APAF1O14727 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
APAF1O14727 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
APAF1O14727 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms