Protein–RNA interactions for Protein: O00399

DCTN6, Dynactin subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN6O00399 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms