Protein–RNA interactions for Protein: C9J3I9

C5orf58, Putative uncharacterized protein C5orf58, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf58C9J3I9 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C5orf58C9J3I9 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms