Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM1B2RUZ4 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms