Protein–RNA interactions for Protein: A6NMD2

GOLGA8J, Golgin subfamily A member 8J, humanhuman

Predictions only

Length 632 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8JA6NMD2 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GOLGA8JA6NMD2 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GOLGA8JA6NMD2 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GOLGA8JA6NMD2 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GOLGA8JA6NMD2 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GOLGA8JA6NMD2 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GOLGA8JA6NMD2 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GOLGA8JA6NMD2 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GOLGA8JA6NMD2 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GOLGA8JA6NMD2 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GOLGA8JA6NMD2 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GOLGA8JA6NMD2 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GOLGA8JA6NMD2 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GOLGA8JA6NMD2 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GOLGA8JA6NMD2 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GOLGA8JA6NMD2 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GOLGA8JA6NMD2 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GOLGA8JA6NMD2 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GOLGA8JA6NMD2 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GOLGA8JA6NMD2 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GOLGA8JA6NMD2 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GOLGA8JA6NMD2 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GOLGA8JA6NMD2 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GOLGA8JA6NMD2 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GOLGA8JA6NMD2 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GOLGA8JA6NMD2 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GOLGA8JA6NMD2 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GOLGA8JA6NMD2 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GOLGA8JA6NMD2 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GOLGA8JA6NMD2 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GOLGA8JA6NMD2 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GOLGA8JA6NMD2 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GOLGA8JA6NMD2 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GOLGA8JA6NMD2 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GOLGA8JA6NMD2 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GOLGA8JA6NMD2 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GOLGA8JA6NMD2 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GOLGA8JA6NMD2 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GOLGA8JA6NMD2 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GOLGA8JA6NMD2 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GOLGA8JA6NMD2 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GOLGA8JA6NMD2 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GOLGA8JA6NMD2 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GOLGA8JA6NMD2 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GOLGA8JA6NMD2 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GOLGA8JA6NMD2 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GOLGA8JA6NMD2 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GOLGA8JA6NMD2 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GOLGA8JA6NMD2 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GOLGA8JA6NMD2 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
GOLGA8JA6NMD2 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GOLGA8JA6NMD2 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GOLGA8JA6NMD2 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GOLGA8JA6NMD2 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GOLGA8JA6NMD2 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GOLGA8JA6NMD2 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GOLGA8JA6NMD2 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GOLGA8JA6NMD2 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GOLGA8JA6NMD2 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GOLGA8JA6NMD2 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GOLGA8JA6NMD2 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GOLGA8JA6NMD2 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GOLGA8JA6NMD2 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GOLGA8JA6NMD2 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GOLGA8JA6NMD2 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GOLGA8JA6NMD2 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GOLGA8JA6NMD2 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GOLGA8JA6NMD2 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GOLGA8JA6NMD2 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GOLGA8JA6NMD2 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GOLGA8JA6NMD2 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GOLGA8JA6NMD2 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
GOLGA8JA6NMD2 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
GOLGA8JA6NMD2 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GOLGA8JA6NMD2 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GOLGA8JA6NMD2 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GOLGA8JA6NMD2 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GOLGA8JA6NMD2 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GOLGA8JA6NMD2 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GOLGA8JA6NMD2 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GOLGA8JA6NMD2 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GOLGA8JA6NMD2 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GOLGA8JA6NMD2 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GOLGA8JA6NMD2 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GOLGA8JA6NMD2 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GOLGA8JA6NMD2 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GOLGA8JA6NMD2 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GOLGA8JA6NMD2 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GOLGA8JA6NMD2 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GOLGA8JA6NMD2 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GOLGA8JA6NMD2 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GOLGA8JA6NMD2 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GOLGA8JA6NMD2 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GOLGA8JA6NMD2 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GOLGA8JA6NMD2 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GOLGA8JA6NMD2 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GOLGA8JA6NMD2 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GOLGA8JA6NMD2 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GOLGA8JA6NMD2 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GOLGA8JA6NMD2 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms